newAD2 - program pro optickou charakterizaci

newAD2 obsahuje tři typy funkcí, které mohou být definovány v sekci functions.

Slouží k získání veličiny odpovídající danému typu měření z Muellerovy matice měření mueller_matrix definované v sekci sample measurement.

```
IsIcIn(mueller_matrix)
```
Funkce IsIcIn předpokládá, že dříve definovaná Muellerova matice odpovídá měření na vzorku s nejvyšší symetrií (izotropní). Potom tato konkrétní funkce vrátí tři nezávislé hodnoty normalizované matice $I_{\rm s}$, $I_{\rm c}$ a $I_{\rm n}$:
$$ M =\left( \begin{array}{cccc} 1 & -I_{\rm n} & 0 & 0 \\ -I_{\rm n} & 1 & 0 & 0 \\ 0 & 0 & I_{\rm c} & I_{\rm s} \\ 0 & 0 & -I_{\rm s} & I_{\rm c} \\ \end{array} \right) \,. $$
```
M00(mueller_matrix)
```
M00 (alternativní název R nebo T) je funkce, která vrátí člen $M_{00}$ z Muellerovy matice, což odpovídá průměrné intenzitě pro s a p polarizovanou složku. Odpovídá odrazivosti, respektive propustnosti, dle typu Muellerovy matice měření.
```
Mp(mueller_matrix)
```
Funkce Mp vrací součet členů $M_{00} + M_{01}$ z Muellerovy matice, odpovídající celkové intenzitě pro p polarizovanou složku.
```
Ms(mueller_matrix)
```
Funkce Ms vrací rozdíl členů $M_{00} - M_{01}$ z Muellerovy matice, odpovídající celkové intenzitě pro s polarizovanou složku.
```
Mueller(mueller_matrix)
```
Funkce vrací celou Muellerovu matici (tedy všech 16 členů).
```
NMueller(mueller_matrix)
```
Funkce vrací normalizovanou Muellerovu matici (celkem 15 členů, bez $M^0_{00}$, který je 1).

Jako argument berou jiné funkce.

Tyto funkci berou jako argument medium definované v sekci media (reprezentované $3\times3$ komplexním dielektrických tenzorem).

```
OC(medium)
```
Funkce OC vrací komplexní index lomu pro medium. Předpokládá, že vstupní dielektrický tensor je izotropní a počítá tedy $\sqrt{\hat{\varepsilon}_{11}}$.
```
DF(medium)
```
Funkce DF vrací komplexní dielektrickou funkci pro medium. Předpokládá, že vstupní dielektrický tensor je izotropní.
```
F(medium)
```
Funkce F vrací komplexní funkci síly přechodu pro medium. Předpokládá, že vstupní dielektrický tensor je izotropní.